抖店商家待开票金额为负数可能是因为商家在抖店中退货、退款或者收到平台补贴等场景导致的。这些场景会减少商家的待开票金额，使其为负数。如果商家的待开票金额一直为负数，可能需要联系抖音客服进行咨询和解决。