抖店回复率是指商家在接收到用户咨询后，所能回复用户的咨询数量和时间占比。如果商家的抖店回复率超过3分钟不达标，可能会对以下三个方面产生影响：

1. 降低用户体验：如果商家不能及时回复用户的咨询，用户可能会感到失望和不满意。这会降低用户在该商家店铺的信任度和忠诚度，从而影响到整个店铺的销售业绩。

2. 惩罚机制: 根据抖音的惩罚机制，回复率低于95%，回复时间超过3分钟的店铺，将会被降低展示权重，在店铺搜索结果中优先被推荐给用户的几率也会降低。

3. 受到平台处罚：如果商家回复率过低，平台会对店铺进行惩罚。商家可能会面临一定的罚款或者限制销售、运营等方面的惩罚措施。